რამდენად ზუსტია Sanger-ის თანმიმდევრობა?
რამდენად ზუსტია Sanger-ის თანმიმდევრობა?

ვიდეო: რამდენად ზუსტია Sanger-ის თანმიმდევრობა?

ვიდეო: რამდენად ზუსტია Sanger-ის თანმიმდევრობა?
ვიდეო: DIMASH SOS. შესრულების ისტორია და წარმატების ანალიზი 2024, მაისი
Anonim

სანგერის თანმიმდევრობა 99.99% სიზუსტე არის კლინიკური კვლევის "ოქროს სტანდარტი" თანმიმდევრობა რა თუმცა, უფრო ახალი NGS ტექნოლოგიები ასევე გავრცელებულია კლინიკურ კვლევით ლაბორატორიებში მათი უფრო მაღალი გამტარუნარიანობისა და თითო ნიმუშის დაბალი ხარჯების გამო.

ასევე იკითხა, რატომ არის NGS უკეთესი ვიდრე Sanger?

სანგერი თანმიმდევრობას შეუძლია მხოლოდ ერთი ფრაგმენტის თანმიმდევრობა ერთდროულად. რადგანაც NGS იყენებს ნაკადის უჯრედებს, რომლებსაც შეუძლიათ მილიონობით დნმ-ის ნაწილის შეკავშირება, NGS შეუძლია ყველა ამ თანმიმდევრობის ერთდროულად წაკითხვა. მაღალი გამტარუნარიანობის ეს ფუნქცია მას ძალიან ეკონომიურს ხდის დნმ-ის დიდი რაოდენობით თანმიმდევრობის დადგენისას.

გარდა ამისა, რა აზრი აქვს Sanger-ის თანმიმდევრობას? სანგერის თანმიმდევრობა არის დნმ-პოლიმერაზას მიერ ჯაჭვის დამწყებ დიდოქსინუკლეოტიდების სელექციური ინკორპორაციის პროცესი ინ ვიტრო დნმ-ის რეპლიკაციის დროს; ეს არის ყველაზე ფართოდ გამოყენებული მეთოდი SNV-ების გამოსავლენად.

შემდგომში შეიძლება ასევე იკითხოს, რა განსხვავებაა Sanger-ის თანმიმდევრობასა და შემდეგი თაობის თანმიმდევრობას შორის?

შემდეგი - თაობის თანმიმდევრობა (NGS) ტექნოლოგიები მსგავსია. კრიტიკული განსხვავება Sanger-ის თანმიმდევრობას შორის და NGS არის თანმიმდევრობა მოცულობა. მიუხედავად იმისა, რომ სანგერი მეთოდი მხოლოდ თანმიმდევრობები დნმ-ის ერთი ფრაგმენტი ერთდროულად, NGS არის მასიურად პარალელური, თანმიმდევრობა მილიონობით ფრაგმენტი ერთდროულად ერთ გაშვებაზე.

როგორ მუშაობს ჯაჭვის შეწყვეტის თანმიმდევრობა?

სანგერის დნმ თანმიმდევრობა ასევე ცნობილია როგორც ჯაჭვი - შეწყვეტა მეთოდი თანმიმდევრობა რა ddNTP-ები იწვევს შეწყვეტა დნმ-ის ჯაჭვის, რადგან ddNTP-ებს არ გააჩნიათ 3'-OH ჯგუფი, რომელიც საჭიროა ნუკლეოტიდებს შორის ფოსფოდიესტერული ბმის ფორმირებისთვის. ამ კავშირის გარეშე, ჯაჭვი წარმოიქმნება ნუკლეოტიდები შეწყდა.

გირჩევთ: