როგორ მუშაობს სანგერის დნმ -ის თანმიმდევრობა?

2024 ავტორი: Stanley Ellington | [email protected]. ბოლოს შეცვლილი: 2023-12-16 00:19

სანჯერის თანმიმდევრობა იწვევს სხვადასხვა სიგრძის გაფართოების პროდუქტების ფორმირებას, რომლებიც მთავრდება 3' ბოლოზე დიდოქსინუკლეოტიდებით. გაფართოების პროდუქტები შემდეგ გამოიყოფა კაპილარული ელექტროფორეზით ან CE. მოლეკულები ელექტრული დენით შეჰყავთ გრძელ მინის კაპილარში, რომელიც სავსეა გელის პოლიმერით.

ამ გზით, რა არის დნმ-ის თანმიმდევრობის სენგერის მეთოდი?

სანგერის თანმიმდევრობა , ასევე ცნობილია როგორც ჯაჭვის შეწყვეტა მეთოდი , არის ტექნიკა დნმ -ის თანმიმდევრობა დაფუძნებული ჯაჭვის დამთავრებული დიდოქსინუკლეოტიდების (ddNTPs) შერჩევით შეერთებაზე დნმ პოლიმერაზა ინ ვიტრო დროს დნმ გამეორება იგი შეიმუშავა ფრედერიკმა სანგერი და კოლეგები 1977 წელს.

ასევე, როგორ მუშაობს ჯაჭვის შეწყვეტის თანმიმდევრობა? სანგერის დნმ თანმიმდევრობა ასევე ცნობილია როგორც ჯაჭვი - შეწყვეტა მეთოდი თანმიმდევრობა რა ddNTP-ები იწვევს შეწყვეტა დნმ-ის ჯაჭვის, რადგან ddNTP-ებს არ გააჩნიათ 3'-OH ჯგუფი, რომელიც საჭიროა ნუკლეოტიდებს შორის ფოსფოდიესტერული ბმის ფორმირებისთვის. ამ კავშირის გარეშე, ჯაჭვი წარმოიქმნება ნუკლეოტიდები შეწყდა.

უბრალოდ, რატომ ვაკეთებთ Sanger-ის თანმიმდევრობას?

სანგერის თანმიმდევრობა არის ა მეთოდი დან დნმ -ის თანმიმდევრობა დაფუძნებული ჯაჭვის დამთავრებული დიდოქსინუკლეოტიდების შერჩევითი ინკორპორაციის საფუძველზე დნმ პოლიმერაზა ინ ვიტრო დროს დნმ გამეორება მას ჯერ კიდევ აქვს უპირატესობა მოკლე წაკითხვასთან შედარებით თანმიმდევრობა ტექნოლოგიები (როგორც Illumina) რომ ის შეუძლია აწარმოოს დნმ -ის თანმიმდევრობა კითხულობს> 500 ნუკლეოტიდს.

სანგერის თანმიმდევრობა ზუსტია?

სანგერის თანმიმდევრობა 99.99% სიზუსტე არის კლინიკური კვლევის "ოქროს სტანდარტი" თანმიმდევრობა რა თუმცა, უფრო ახალი NGS ტექნოლოგიები ასევე გავრცელებულია კლინიკურ კვლევით ლაბორატორიებში მათი უფრო მაღალი გამტარუნარიანობისა და თითო ნიმუშის დაბალი ხარჯების გამო.